蝴蝶兰常见病虫害主要有：疫病、灰霉病、炭疽病、白绢病、煤病、软腐病、蓟马、介壳虫、蛞蝓、蝗虫等。
蝴蝶兰常见病害
- 疫病，主要发生在瓶苗出瓶、移植及植株换盆移动时。在蝴蝶兰叶片花器假鳞茎及新芽上，没有伤口也可侵入，初期中部出现水浸状斑点，后期扩大为暗绿色，虽然腐烂但不会被水解而溃烂，亦无恶臭，最后造成全株枯死。预防胜于治疗，在瓶苗出瓶时、种植及换盆应马上施用3.5%依得利，可湿性粉剂1500倍稀释液或使用亚磷酸配合氢氧化钾各1000倍混合效果甚佳，每周一次，2-3次即可。
蝴蝶兰疫病
- 灰霉病，在蝴蝶兰冬春季节，低温多湿时花瓣容易感染而降低花朵质量。首先在花瓣及萼片上出现水浸状圆形小点，逐渐变成大小约0.1-0.15厘米的褐色斑点。防治方法为温度保持干燥可减少发生，严重时可用以下药剂治疗：50%扑灭宁，可湿性粉剂2000倍液或50%依普同，可湿性粉剂1500倍液对其喷之，病害发生7-10天喷肥一次，连续三次或者50%扑灭宁可湿粉剂、50%依普同可湿性粉剂，23.7%福元精水悬粉、50%益发剂。（欲使用之药剂先试喷少许植株，确定对蝴蝶兰花朵无药害后再喷施）。
- 炭疽病， 一般植株栽培太密或高温多湿季节，特别是梅雨季节或台风过后，植株叶片极易患病。初期在叶片上产生淡褐色凹陷和小斑点，逐渐扩大为不规则形，颜色呈黑褐色，病斑中部再有坏疽时会脱落而呈穿孔现象。防治方法为加强肥水管理，增加植株抵抗力，改善栽培环境，增加通风及日照，施用锌肥，增加叶片厚度，防止疫病侵入，合理使用杀虫剂；如：扑拉克1500倍液或扑拉克锰2000倍液，且明显效果。也可用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液或咪鲜胺3000倍液，每周喷洒1次。
- 白绢病，在高温多湿时靠近地面的茎部极易发生。植物接近地面附生组织出现水渍状病斑，后呈不同程度的褐色到黑褐色坏疽后再生出白色绢状丝使植物萎凋而死。由于白绢病大多位于土壤中，因此预防此病特别注意清洁卫生，应使用清洁干净的栽培材料以及栽培容器，否则栽培介质也应事先蒸汽消毒，用0.6%尿素注入后覆盖一周，并保持环境卫生，发生时可用50%福多宁倍液或75%灭普宁一倍液施用，每周一次连续3-5周。
- 煤病，一般发生于栽培时通风不良，日照较强时易发生，有时日照低时也会发生，成株叶片也较易发生。在成株叶片的叶缘，初期分泌汁液密露，再感染煤烟，病菌使叶绿汁液变成黑褐色，影响植株观赏。严重时可施用5%扑灭宁，可湿性粉剂2000倍液，可湿性粉剂1000倍23.7%依普同，福元精。
煤病
- 软腐病，在高温多湿的环境下极易感染。蝴蝶兰叶片不同部位均可感染，叶片首先出现水浸状呈透明软腐现象，蔓延速度很快，导致数天内植株死亡。防治方法为定期轮流喷施30.3%铂美京，可溶性粉剂1000倍液，若感染做好整盆丢弃，避免传染。
虫害
- 蓟马，蓟马的成虫幼虫怕光，主要分布于花瓣的重叠处，褶皱处。主要危害蝴蝶兰的花朵，初期易发现，植株受害后在花瓣上出现横条或点状斑纹，致使花朵变形，萎蔫干枯。防治方法为用黄色粘板诱杀，通常使用内吸剂，如用5%辛硫磷乳剂1 000-1 500倍液等喷洒防治。
- 介壳虫，寄生于兰花的茎、叶鞘、花梗等部位。植物生长衰弱，甚至萎缩死亡，受害花色暗淡，严重时叶片黄化、枯萎、脱落。利用介壳虫固定在一个地方，不会自行移动的特点，用软毛刷将虫介连同虫体一起清除，并用水冲洗干净，另外采用喷洒氧化乐果等除虫。
- 蛞蝓，高温多湿的夏天，傍晚及夜间最为严重。可嚼食植物幼嫩组织，如嫩叶、根端、花蕾、花瓣等。造成不规则的伤痕及洞穴，影响兰花外观及生长，而且病害传染相当快速，短期间就可造成很多兰花受害。采用毒饵诱杀，如蜗克星1-2袋棚或生石灰10-20千克，硼均撒施在它们正常活动的地方诱杀，或兰花的基质表面撒土8%灭菌灵颗粒剂。
- 蝗虫分布在叶片或者整个植株上。能咬食叶片，伤害蝴蝶兰之株体。可施用免敌克1000倍液，或用人工捉除。
